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一、商业银行会计内部控制体系存在的主要问题
纵观银行业内部会计控制的现实状况，主要存在的问题有以下几个方面：
（一）商业银行内部控制意识淡薄。
内部控制需要一个银行内部每个工作人员参与这一过程。许多人员对银行内部控制意识淡薄，对执行内部控制制度的重要性认识不足，尤其是前台一线业务操作人员，有时为了增长业绩，为了完成任务而完成任务，往往以感情替代规章，疏于内部控制、违章操作、违反规定程序办理业务，从而形成事故隐患。银行会计业务如果处理不好，也可能直接引发资金风险，损害银行信誉。
（二）会计内部控制制度不健全。
长期以来，商业银行根据自身的特点和会计业务发展的需要，不断加强内部控制制度建设，出台了一系列的制度办法，在实践中也发挥了较好的监督和制约作用。会计内部控制制度缺乏统筹性、整体性建设。当前，会计内部控制的相关要求依旧是被支离破碎地分解到各项法规、制度、办法之中，依旧没能形成一套系统性的内部操作规程、内部控制制度和准确的评价标准，这种现象是不利于会计人员全方位地学习和落实内部控制制度的，对相关部门进行内部控制制度的执行情况的监督检查和评价也是不利的。
（三）会计内部控制制度执行不力。
为防范会计风险，我国银行业在过去几十年的业务经营中，建立了一系列相对完善、行之有效的内部控制制度，但这些制度没有得到很好的贯彻执行，制度的权威性和严肃性受到严重挑战，造成有章不循、违章操作现象时有发生。有章不循和违章操作现象是普遍存在的。一些商业银行业务分工时不免会存在会计人员违反规定兼岗及兼职的问题，重要的岗位和重要的责任没有执行严格分离，将导致岗衡机制的失效，存在着风险隐患。这种现象的原因是，首先是上级行制定出的一些具体业务制度和办法原则性太强，操作性不强；其次是业务经办人员对业务的处理具有主观的随意性，会计管理人员也没能及时给予纠正。
（四）会计内部监督弱化。
银行是高风险行业，所以重视会计监督、检查与辅导，设有专门的事后监督、内部审计等部门及会计辅导岗位，应该说机构设置较健全。然而，在实际工作中，内部稽核力量配备不足，人员素质不能适应工作需要。一方面有些银行不重视稽核工作，在稽核人员配备上未按实际工作量进行配备，对稽核人员的综合素质也未作具体要求，只要做过银行会计或储蓄工作就可胜任，殊不知已无法适应目前推行的综合柜员制业务处理模式；另一方面因对稽核人员缺乏系统培训，造成内部稽核人员中熟悉单项业务的人员较多，具有综合业务素质的人员较少；熟悉传统会计业务的人员较多，了解创新业务的人员较少；熟悉国内结算业务的人员较多，熟悉国际金融业务的人员较少。且部分稽核人员平时又不注重业务学习，及时更新知识，以至稽核人员的政策法规水平和业务技能跟不上形势发展的需要，难以适应会计业务发展，往往只对会计业务的表面现象进行稽核，无法进行深层次稽核，从而使内部稽核流于形式、徒有虚名，对操作人员的一些违规做法不能及时指正，管理监督乏力。
（五）会计队伍整体素质与人员配备难以适应会计工作的需要。
银行会计人员素质的高低，直接影响到会计各项业务处理的质量，高素质的人员不仅是会计内部控制发挥作用的基础，而且可以弥补会计内部控制制度的不足。随着金融创新业务不断增多，服务领域不断拓展，为了占领市场份额，实行外延式的扩张，在员工的使用方面忽视了会计人员的素质，各基层机构基本上都存在着人员少、新手多、学历低、队伍不稳定等问题，从而为商业银行的经营风险埋下了隐患。会计人员素质不高。有些基层行认为会计仅仅是基础工作，是简单的操作部门，对会计从业人员的业务素质、政治思想要求不高，从而影响了会计工作的连续性和会计人员的稳定性，这都阻碍了内部控制制度的有效执行。会计部门培训的方式、方法相对落后，岗位培训流于形式。对于新增会计人员培训，基本沿用过去那种“师傅带徒弟”的传统做法，接触到什么教什么，而且不少师傅自己的会计处理经验、技能尚不够全面和准确，缺乏系统的业务培训。
二、完善商业银行会计内部控制体系的对策
（一）牢固树立正确的内部控制理念
1、内部控制是全员、全过程、全方位的。有人认为，内部控制是管理部门的事情，业务经办部门和经办人员就不用管了；或者认为内部控制是稽核审计的事情，与其他部门无关；还有的人认为内部控制在关键环节做一做就行了。这些看法是不全面的，无论是《巴塞尔新资本协议》，还是中国人民银行和中国银监会的内部控制指引，都明确提出内部控制应该是全员、全过程和全方位的，应当渗透到商业银行的各项业务过程和各个操作环节，覆盖所有部门、岗位和人员。内部控制活动应当成为银行日常经营必不可少的一部分，从经营部门、管理部门再到稽核审计部门，都是内部控制链条中不可缺少的环节。内部控制需要董事会、高级管理层和价格及工作人员共同努力才能实现，银行的每个员工都必须参与这一过程。
2、培育员工的风险意识是加强内部控制的必要条件。商业银行的内部控制归根到底是由人来进行的控制，内部控制制度的设计、制定和具体实施都是与商业从业人员的行为密不可分。因此，就要做到以人为本，培育良好的银行内部控制文化，使人的自主行为与制度对人的行为的约束有机结合。内部控制文化是商业银行进行内部控制的“灵魂”，它使得银行的内部控制更加有效，银行也更具有生命力。
（二）进一步完善商业银行内部控制制度
1、岗位责任制度。商业银行经营目标的实现是由内部各个岗位共同配合完成的，所以建立岗位责任制度尤为重要。
2、业务操作制度。商业银行应建立操作规程为基础，岗位独立、人员分工、职责明晰的业务操作制度。
3、资料保全制度。信息资料是对业务过程的全面记载，是商业银行经营活动的重要凭证，对业务检查和稽核至关重要。
4、授权授信制度。随着现代金融业经营规模的不断扩大，经营项目日趋增多，业务活动日益复杂多样。因此，上级必须将权责进行合理的划分，对下级授权、分权，明确各级人员处理某项业务的权利，同时权责挂钩、权责对等。
（三）加强会计内部控制制度的执行力。
为将工作流程和关键环节落到实处，要做到层层落实责任制，明确相关责任人，实行责任追究制度。每一事项，都明确第一、第二责任人，每日相互跟踪复查，每旬会计主管跟踪检查。保证每一名柜员均有一名直线主管及第二责任人督导其完善日常工作。每月计财部门进行专项检查，落实各项规章制度的考核，对内部管理屡查屡犯的现象加倍处罚。不仅如此，计财部还针对支行营业部这一重点内部控制管理单位，采取了每日检查重要内容的措施，加强对会计主管日常工作的督导。每天进行五项不同重要内容的检查，重点解决会计主管的职责履行到位、业务操作风险点防范与控制到位的问题。每周进行一次总结，形成书面督导报告，通报各营业机构。并对重点时段、重要事项下达临时书面督导通知，按年度编号，要求各营业单位作书面回执，及时调度营业单位的重要工作进度，使重要事项不疏不漏。
（四）建立健全监督检查机制。
商业银行要加强对内部控制的监督，通过对内部控制的监督，发现内部控制存在的缺陷，提出改进的建议，以达到差错纠弊的目的。商业银行内部控制的监督手段中最主要的是内部审计，对于我国商业银行而言，内部审计有着重要的意义。
（五）切实提高会计人员整体素质。
加强后续教育培训和考核。如果对会计人员考核不严，将并不能使会计人员的素质得到提高。加强实施会计人员的考核制度和继续教育。把年检工作落到实处。管理部门可以出台一些激励措施，大力支持会计人员通过各种形式自学。实行会计岗位定期轮换制度。若会计人员长时间内从事某一具体的岗位工作，有利于提高员工的连续性和熟练性，但这样做不利于会计人员全面掌握各个岗位的业务。因而，应定期对内部岗位分工进行轮换，从而使会计人员能够在各个不同的业务岗位上都得到实践和发挥自己的机会，同时促进员工相互交流，提升会计人员的业务水平。